自吸式波纹补偿器工作原理，自吸波纹补偿器运行以后，叶轮将预先灌入室储水腔的水及从进口管道里面所抽的空气一起吸入，水和空气在经过叶轮高速旋转之后达到完全混合的效果，液体夹带着气体在离心力的作用之下向涡卷室外缘排出。液体夹带着气体通过扩散管进入气水分离室。

这时，因为水的流速突然降低，空气是比水要轻的气体会向上走，气体就会从气水混合物中被排离出来，空气会通过各种橡胶叶轮的排气口及排水出口排出。分离了空气之后的水回到储水腔，再由回流孔再次回到叶轮的吸水端，再次与自吸波纹补偿器进口管道中被叶轮吸入的空气混合在一起，在高速旋转的叶轮作用下，又流向叶轮外缘。

随着这个过程来回往复的地进行下去，自吸波纹补偿器进口管道中的空气不断排出减少，一直到最后排尽进口管道的空气，形成一定负压之后水会逐渐由水池被提升到泵体里面来，这样就完成了自吸过程，自吸波纹补偿器抽上来水之后就能正常出水。自吸波纹补偿器的橡胶叶轮体底部还可以设冷却室来冷却橡胶叶轮，如果橡胶叶轮因为安装使用上面的缘故导致橡胶叶轮体发热温度超过了70度时，可在这里接一根冷却液管道，注入冷却液循环冷却。